В предвоенные годы Ленинградская кондитерская фабрика им. К.Самойловой была в числе 15-ти самых крупных предприятий страны и входила в состав Главного Управления кондитерской промышленности СССР. Годовой выпуск продукции достигал 26774 тонны при численности работающих 1977 человек. На фабрике планировалась реконструкция с возведением новых производственных зданий и специализированного склада, закупка импортного оборудования, строительство жилых домов и даже дачного поселка.

В одночасье этот проект прервали сирены противовоздушной обороны. Все планы перечеркнула война и начавшаяся блокада города. На повестке дня стояли вопросы экономного расходования сырья и материалов. Было решено максимально бережно использовать оставшееся пищевое сырье на фабрике. Каждый килограмм муки и сахара был взят на строгий учет. Выпекали галеты и печенье для отправки на фронт и выдачи пайков ленинградцам.

С первых же дней войны начались изнурительные бомбежки и артобстрелы, вызывавшие пожары, разрушения и гибель людей. Сохранилась схема поражений фабрики им.Самойловой от артиллерийских обстрелов. Всего во время блокады, которая продолжалась два с половиной года, на территории предприятия разорвалось 10 авиабомб и 66 артиллерийских снарядов.

Первый обстрел случился 6 ноября 1941 года и разрушил химическую лабораторию фабрики. 15 ноября 1941 года в 15 час. 20 мин. 150-мм. снаряд попал в дражейный цех. Вся находившаяся на участке продукция в количестве 741 кг. была засыпана щебенкой, пылью, перемешана с золой. Много бед принес артобстрел 5 декабря 1941 года, были выбиты почти все стекла фасада, обрушены кровля и потолки в нескольких цехах. Было испорчено более 60 кг. полуфабрикатов, 120 кг. шоколада, более 40 кг. шоколадной массы и какао-масла. Среди рабочих было ранено 9 человек, а один убит. Воздушная тревога объявлялась по 15-20 раз за сутки. Оставшиеся на фабрике люди день и ночь оберегали бисквитный цех, который еще продолжал частично работать.

Рабочие предприятия в первые дни войны участвовали в возведении оборонительных заграждений под Ораниенбаумом, в районе Котлов и Стрельны, заготавливали дрова и торф.

В июне 1942 года Военный совет Ленинградского фронта и руководство города принимают решение остановить фабрику. Когда были осуществлены все мероприятия по консервации цехового оборудования, остались лишь охрана и команда МПВО. Они тушили зажигательные бомбы, разбирали завалы. Жили прямо на фабрике в тарных сушилах. Это место казалось самым безопасным и к тому же теплым.

В самые первые дни войны добровольно ушли на фронт свыше 200 самойловцев, многие записались в народное ополчение. Одним из таких добровольцев был механик бисквитного цеха А.Г. Марков. Служил на Балтике до самого окончания войны. Получил общую контузию, имел ранения. Награжден орденом Красной звезды и несколькими медалями. В сентябре 1945 года вернулся на фабрику и работал начальником гофренного цеха, затем стал главным механиком фабрики. В трудовом коллективе до сих пор его помнят не только как фронтовика и высококлассного специалиста, но и как одного из самых активных рационализаторов и изобретателей. На его счету десятки новаторских предложений по усовершенствованию механизмов и аппаратов для кондитерской отрасли.

На войну с фабрики ушел еще один мастер, впоследствии ставший заслуженным рационализатором республики – В.А. Чижов. Он воевал на Волховском фронте. Был оружейным мастером в зенитном дивизионе. Ремонтировать орудия часто приходилось под огнем вражеских батарей. Когда вернулся в родной город, оказалось, что в его дом попала бомба, а семья находилась в эвакуации. Однако у ветерана был второй дом – фабрика, где наиболее ярко проявились его смекалка и творческий талант.

Обязанности санинструктора, повара и связиста приходилось совмещать работнице котельной Е.Т. Ермаковой во время службы в 569 легком артиллерийском полку, который принимал участие в прорыве блокады Ленинграда. Вот что она говорила: «Наша победа была возможна только благодаря героическому труду всего нашего народа и героической Красной Армии. Нашей победе способствовала крепкая дружба солдат на фронте».

Всю войну не прерывалась связь между воинами-самойловцами и теми, кто остался на фабрике. 7 января 1942 года газета «Смена» в заметке «Переписка с фронтом» поместила письмо красноармейца Анатолия Воеводина. Он писал: «Знайте, что мы полны несокрушимой веры в нашу победу и сделаем все для разгрома врага. Будьте и вы мужественными, самоотверженными бойцами трудового фронта, делайте все для нашей Победы!». В ответ ему писали: «Постараемся во всем походить на тебя, Толя, и твоих боевых товарищей. Вместе с вами мы будем бить врага до полного уничтожения». А молодые работницы из команды МПВО вязали и отправляли бойцам теплые носки, в которые вкладывали небольшие записочки с приветом из тыла.

Приближался 1944 год. Чувствовалось наступление важного события. «27 января, - вспоминает одна из сотрудниц, - я была на Ленинградском фронте, когда стало известно о прорыве блокады города. Сколько было радости на лицах, сколько в эти минуты пролилось слез! И хотя враг еще не был разбит окончательно, Ленинград вырван из тисков голода и смерти, ему стало дышать вольнее».

29 марта 1944 года Государственным Комитетом Обороны было подписано постановление о начале восстановительных работ и пуске фабрики. Уже в начале июня для производства было создано 62 рабочих места и выработаны первые килограммы кондитерских изделий. К июлю была восстановлена парокотельная фабрики и возобновилось изготовление печенья, а к октябрю частично сдан в эксплуатацию конфетный цех.

В конце 1944 года на фабрику поступил очень важный заказ. В городе было решено устроить для маленьких ленинградцев новогодние елки. Заказ был выполнен досрочно. Свыше 400 тысяч сладких наборов получили дети. Это были первые новогодние подарки за все время блокады.